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如何選擇illumina文庫制備試劑盒
瀏覽次數(shù):3發(fā)布日期:2020-10-09
     


測序原始樣本來源豐富,可分為DNA和RNA測序,下面進(jìn)行DNA測序文庫制備試劑盒的區(qū)分和選擇進(jìn)行對比:

可分為TruSeq和Nextera



相關(guān)產(chǎn)品如下:

品牌

貨號

產(chǎn)品名稱

包裝量

產(chǎn)品特點

Illumina

IP-202-1012

TruSeq ChIP   Library Preparation

12 indexes, 48 Rxns

ChIP來源DNA染色質(zhì)免疫沉淀測序文庫制備

Illumina

20020614

TruSeq DNA Exome

24 樣本

外顯子組文庫制備

Illumina

20015964

TruSeq   Nano DNA Low Throughput Library Prep Kit

24 samples

100-200ng起始DNA,6h操作時間

Illumina

20015965

TruSeq  Nano DNA High Throughput Library Prep Kit

96 samples

Illumina

20015962

TruSeq   DNA PCR-Free Low Throughput Library Prep Kit

24 samples

1-2ug起始

Illumina

20015963

TruSeq  DNA PCR-Free High Throughput Library Prep Kit

96 samples

Illumina

FC-121-1030/1031

Nextera   DNA Library Prep Kit

24/96 samples

50ng 起始


Illumina

FC-131-1024

Nextera XT   DNA Library Preparation Kit

24 samples

1ng 起始,耗時1.5h

Illumina

FC-131-1096

Nextera XT   DNA Library Preparation Kit

96 samples


總結(jié):

TruSeq DNA建庫方法復(fù)雜,文庫起始量500ng,對DNA質(zhì)量要求較,成本較低,基因組覆蓋度較高。------------采用超聲波方法對DNA進(jìn)行隨機(jī)打斷,然后加接頭,片段篩選和PCR擴(kuò)增


Nextera DNA建庫方法簡單,文庫起始量50ng,對DNA質(zhì)量要求較,成本較高,基因組覆蓋度較低。------------采用轉(zhuǎn)座酶隨機(jī)插入并將基因組DNA打斷成長度大小為300bp左右的片段,同時將測序所需的adaptor直接在插入打斷的同時連接到片段的兩端



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