Illumina
美國Illumina公司自2006年進軍基因測序市場以來,陸續(xù)發(fā)布了HiSeq、MiSeq、NextSeq等一系列測序儀器。
(Illumina公司的各型號測序儀)
測序方法采用邊合成邊測序的方法,基于專有的可逆終止化學反應原理。測序時將基因組DNA的隨機片段附著到光學透明的玻璃表面(即Flow cell),這些核酸片段經(jīng)過延伸和橋式擴增后,在Flow cell上形成了數(shù)以億計Cluster,每個Cluster是具有數(shù)千份相同模板的單分子簇。然后利用帶熒光基團的四種特殊脫氧核糖核苷酸,通過可逆性終止的SBS(邊合成邊測序)技術對待測的模板DNA進行測序。
(Illumina測序原理)
illumina 平臺眾多,各有側重,適合不同樣本測序,下面介紹illumina主流測序儀器的區(qū)別,大家可根據(jù)實際需求選擇合適的測序平臺!
不同儀器應用如下:
第二代測序技術的核心思想是邊合成邊測序(Sequencing By Synthesis),即通過捕捉新合成的末端的標記來確定DNA的序列,其中Illumina公司處于一個壟斷地位,下面就illumina產(chǎn)品進行介紹:
詳細介紹如下:
MiniSeq系統(tǒng):門檻最低、最易于實現(xiàn)的測序解決方案。即使是少量的樣本,它也能夠實現(xiàn)經(jīng)濟高效的測序。
單次數(shù)據(jù)產(chǎn)出范圍在1.65-7.5Gb
Reads數(shù):7-25 million
應用:靶向基因、小基因組、擴增子測序、16S宏基因組學等。
MiSeq 系統(tǒng):適用于快速、省成本的二代測序可以在單次運行中讀取
2X300bp的長度。
單次數(shù)據(jù)產(chǎn)出范圍在540Mb-15Gb
Reads數(shù):1-25 million(v2達到15 million,v3達到 25million)
應用:靶向基因、小基因組、擴增子測序、16S宏基因組學等。
NextSeq 550系統(tǒng):快速、靈活、高通量的臺式測序儀,在Illumina測序技術準確性的基礎上,實現(xiàn)轉錄組和靶向重測序應用。
可以在單次運行中讀取2X150bp的長度。
單次數(shù)據(jù)產(chǎn)出范圍在1.65-7.5Gb
Reads數(shù):7-25 million
應用:在Illumina測序技術準確性的基礎上,實現(xiàn)轉錄組和靶向重測序應用。
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